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La Commission européenne est une institution ayant des pouvoirs d'initiative, d'exécution, de gestion et de contrôle. Elle est la gardienne des traités et incarne l'intérêt communautaire. Elle est composée d'un collège de 20 membres indépendants (2 membres pour l'Allemagne, l'Espagne, la France, l'Italie et le Royaume-Uni et 1 membre pour chacun des autres pays), dont un président et deux vice-présidents. Elle est nommée à la majorité qualifiée pour 5 ans par le Conseil en accord avec les États membres. Elle est soumise, à un vote d'investiture du Parlement européen, devant lequel elle est responsable. Le collège des commissaires est assisté par une administration composée de directions générales et de services spécialisés dont le personnel est réparti principalement entre Bruxelles et Luxembourg.

La nouvelle Commission, qui a été mise en place le 23 janvier 2000 pour un mandat de 5 ans a entamé des réformes importantes dans l'organisation de son administration afin de moderniser ses méthodes de travail et ses procédures, et de garantir une prise de décision véritablement collégiale, tout en ayant recours plus largement aux habilitations dans des domaines déterminés par exemple la politique régionale, la politique agricole commune et le marché intérieur. L'importance que la Commission accorde à sa réforme interne s'est reflétée dans un livre blanc adopté le 1er mars 2000. Ce dernier prévoit trois grands axes pour la réforme:

fixation des priorités et affectations des ressources;
révision globale de la politique en matière d'encadrement et de gestion des ressources humaines;
amélioration de la gestion, de l'efficacité et de la responsabilisation financières.

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